Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOCD1Q6ZMY3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPOCD1Q6ZMY3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms