Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP26C1Q6V0L0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP26C1Q6V0L0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP26C1Q6V0L0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP26C1Q6V0L0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP26C1Q6V0L0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP26C1Q6V0L0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYP26C1Q6V0L0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP26C1Q6V0L0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms