Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNT2Q6UVM3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNT2Q6UVM3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNT2Q6UVM3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms