Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUPD1Q68J44 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DUPD1Q68J44 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms