Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND4CQ5VZ89 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms