Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCERG1LQ5VWI1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCERG1LQ5VWI1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms