Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC38Q5VT99 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC38Q5VT99 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.5 ms