Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC183Q5T5S1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.2 ms