Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTLL9Q3SXZ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms