Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms