Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD1Q15797 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD1Q15797 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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