Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOMM20Q15388 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOMM20Q15388 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOMM20Q15388 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOMM20Q15388 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOMM20Q15388 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOMM20Q15388 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOMM20Q15388 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TOMM20Q15388 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOMM20Q15388 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOMM20Q15388 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TOMM20Q15388 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOMM20Q15388 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOMM20Q15388 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOMM20Q15388 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOMM20Q15388 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOMM20Q15388 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOMM20Q15388 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TOMM20Q15388 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TOMM20Q15388 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms