Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL9A3Q14050 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
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COL9A3Q14050 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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COL9A3Q14050 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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COL9A3Q14050 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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COL9A3Q14050 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
COL9A3Q14050 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
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