Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A6Q14031 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms