Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIRBPQ14011 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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