Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H3Q13889 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms