Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKP1Q13835 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
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