Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RPL18Q07020 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL18Q07020 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms