Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDPQ00604 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDPQ00604 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDPQ00604 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDPQ00604 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDPQ00604 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDPQ00604 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDPQ00604 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDPQ00604 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDPQ00604 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDPQ00604 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDPQ00604 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDPQ00604 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDPQ00604 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDPQ00604 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDPQ00604 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDPQ00604 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDPQ00604 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDPQ00604 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDPQ00604 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDPQ00604 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDPQ00604 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDPQ00604 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDPQ00604 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDPQ00604 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDPQ00604 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDPQ00604 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDPQ00604 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDPQ00604 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDPQ00604 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDPQ00604 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDPQ00604 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDPQ00604 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDPQ00604 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDPQ00604 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDPQ00604 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDPQ00604 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NDPQ00604 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDPQ00604 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDPQ00604 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDPQ00604 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDPQ00604 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDPQ00604 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDPQ00604 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDPQ00604 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NDPQ00604 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDPQ00604 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDPQ00604 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDPQ00604 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NDPQ00604 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NDPQ00604 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NDPQ00604 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NDPQ00604 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDPQ00604 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDPQ00604 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDPQ00604 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDPQ00604 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDPQ00604 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDPQ00604 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDPQ00604 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDPQ00604 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDPQ00604 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDPQ00604 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDPQ00604 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDPQ00604 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDPQ00604 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDPQ00604 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDPQ00604 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDPQ00604 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDPQ00604 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDPQ00604 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDPQ00604 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDPQ00604 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDPQ00604 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDPQ00604 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDPQ00604 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms