Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FANCCQ00597 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FANCCQ00597 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms