Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL1Q00532 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms