Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP2P81877 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms