Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTNAP1P78357 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTNAP1P78357 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTNAP1P78357 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms