Protein–RNA interactions for Protein: P78344

EIF4G2, Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4G2P78344 RUNX1-204ENST00000399237 822 ntTSL 529.84■■■□□ 2.377e-7■■■■■ 39.1
EIF4G2P78344 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.397e-7■■■■■ 39.1
EIF4G2P78344 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.777e-7■■■■■ 39.1
EIF4G2P78344 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.381e-8■■■■■ 39.1
EIF4G2P78344 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.391e-8■■■■■ 39.1
EIF4G2P78344 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 39.1
EIF4G2P78344 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.812e-9■■■■■ 39.1
EIF4G2P78344 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.098e-7■■■■■ 39
EIF4G2P78344 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.175e-7■■■■■ 39
EIF4G2P78344 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.995e-7■■■■■ 39
EIF4G2P78344 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)27.33■■□□□ 1.975e-7■■■■■ 39
EIF4G2P78344 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.695e-7■■■■■ 39
EIF4G2P78344 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.655e-7■■■■■ 39
EIF4G2P78344 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 39
EIF4G2P78344 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 39
EIF4G2P78344 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 38.9
EIF4G2P78344 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 38.9
EIF4G2P78344 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.991e-6■■■■■ 38.9
EIF4G2P78344 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 327.99■■■□□ 2.071e-6■■■■■ 38.9
EIF4G2P78344 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.941e-6■■■■■ 38.9
EIF4G2P78344 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.841e-6■■■■■ 38.9
EIF4G2P78344 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 525■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 38.9
EIF4G2P78344 AL121845.3-202ENST00000632538 872 ntAPPRIS P1 TSL 329.82■■■□□ 2.362e-6■■■■■ 38.9
EIF4G2P78344 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 35.46□□□□□ -1.543e-9■■■■■ 38.8
EIF4G2P78344 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.828e-7■■■■■ 38.8
EIF4G2P78344 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.347e-7■■■■■ 38.8
EIF4G2P78344 SLC6A19-202ENST00000515652 3337 ntTSL 216.27■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 38.8
EIF4G2P78344 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.611e-6■■■■■ 38.8
EIF4G2P78344 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.611e-6■■■■■ 38.8
EIF4G2P78344 CERS4-203ENST00000558268 713 ntTSL 335.3■■■■□ 3.242e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.572e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.332e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.282e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 CERS4-214ENST00000595722 1826 ntTSL 1 (best)27.74■■■□□ 2.032e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.022e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 CERS4-213ENST00000561053 768 ntTSL 527.59■■■□□ 2.012e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.882e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 CERS4-206ENST00000558501 873 ntTSL 524.38■■□□□ 1.492e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 CERS4-211ENST00000560412 568 ntTSL 424.12■■□□□ 1.452e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 CERS4-212ENST00000561008 531 ntTSL 421.22■□□□□ 0.992e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 CERS4-207ENST00000558877 758 ntTSL 318.52■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 HDAC1-207ENST00000481281 721 ntTSL 518.21■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 HDAC1-203ENST00000463172 895 ntTSL 218.21■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 HDAC1-202ENST00000428704 664 ntTSL 211.87□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 HDAC1-205ENST00000472928 532 ntTSL 28.86□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.852e-6■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.782e-6■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 SNAP47-205ENST00000426344 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.8■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 SNAP47-208ENST00000478768 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.62□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 PAK4-204ENST00000593480 714 ntTSL 327.65■■■□□ 2.025e-7■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 425.68■■□□□ 1.75e-7■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.695e-7■■■■■ 38.7
EIF4G2P78344 AC009119.2-202ENST00000563312 458 ntTSL 219.58■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 38.6
EIF4G2P78344 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 38.6
EIF4G2P78344 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 38.6
EIF4G2P78344 AC009119.2-203ENST00000566309 583 ntTSL 27.38□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 38.6
EIF4G2P78344 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 38.6
EIF4G2P78344 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 38.6
EIF4G2P78344 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 38.6
EIF4G2P78344 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 38.5
EIF4G2P78344 SLC9A1-201ENST00000263980 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 38.5
EIF4G2P78344 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.959e-8■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 LRRC4B-203ENST00000600381 853 ntTSL 224.52■■□□□ 1.529e-8■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-222ENST00000552897 596 ntTSL 433.91■■■■□ 3.024e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-216ENST00000551096 530 ntTSL 429.78■■■□□ 2.364e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-212ENST00000549279 544 ntTSL 428.12■■■□□ 2.094e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-217ENST00000551099 570 ntTSL 427.5■■□□□ 1.994e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-219ENST00000552077 3293 ntTSL 222.05■■□□□ 1.124e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.024e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.764e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-215ENST00000550873 527 ntTSL 516.29■□□□□ 0.24e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-204ENST00000541517 5173 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.184e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-223ENST00000552985 762 ntTSL 315.73■□□□□ 0.114e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-221ENST00000552642 526 ntTSL 413.75□□□□□ -0.214e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 TPCN1-209ENST00000547275 564 ntTSL 413.09□□□□□ -0.314e-15■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 CNOT6L-208ENST00000515506 4024 ntTSL 514.14□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 38.4
EIF4G2P78344 PIP4K2A-205ENST00000474335 559 ntTSL 223.02■■□□□ 1.283e-18■■■■■ 38.3
EIF4G2P78344 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.827e-7■■■■■ 38.3
EIF4G2P78344 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.397e-7■■■■■ 38.3
EIF4G2P78344 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 38.3
EIF4G2P78344 RAB8A-207ENST00000592971 300 ntTSL 20.46□□□□□ -2.347e-7■■■■■ 38.3
EIF4G2P78344 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 38.3
EIF4G2P78344 GRB10-212ENST00000439044 733 ntTSL 531.22■■■□□ 2.592e-8■■■■■ 38.3
EIF4G2P78344 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 38.2
EIF4G2P78344 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.751e-17■■■■■ 38.2
EIF4G2P78344 RNFT2-205ENST00000547718 1761 ntTSL 227.22■■□□□ 1.958e-7■■■■■ 38.1
EIF4G2P78344 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.728e-7■■■■■ 38.1
EIF4G2P78344 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.78e-7■■■■■ 38.1
EIF4G2P78344 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.648e-7■■■■■ 38.1
EIF4G2P78344 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.028e-7■■■■■ 38.1
EIF4G2P78344 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.58e-7■■■■■ 38.1
EIF4G2P78344 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.196e-8■■■■■ 38.1
EIF4G2P78344 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.886e-8■■■■■ 38.1
EIF4G2P78344 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.276e-8■■■■■ 38.1
EIF4G2P78344 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.765e-7■■■■■ 38.1
EIF4G2P78344 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.265e-7■■■■■ 38.1
EIF4G2P78344 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.145e-7■■■■■ 38.1
Retrieved 100 of 8,962 protein–RNA pairs in 48.1 ms