RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549279.1

TPCN1-212, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPCN1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-212ENST00000549279 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.2■■■■■ 5.47
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TPCN1-212ENST00000549279 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.39■■■■■ 4.22
TPCN1-212ENST00000549279 NACADO15069 1562 aa41.29■■■■■ 4.2
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TPCN1-212ENST00000549279 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.73■■■■□ 3.79
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TPCN1-212ENST00000549279 SMARCA2P51531 1590 aa38.05■■■■□ 3.68
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TPCN1-212ENST00000549279 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.86■■■■□ 3.65
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TPCN1-212ENST00000549279 ERCC6Q03468 1493 aa37.19■■■■□ 3.54
TPCN1-212ENST00000549279 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.14■■■■□ 3.54
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TPCN1-212ENST00000549279 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.96■■■■□ 3.51
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TPCN1-212ENST00000549279 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.64■■■■□ 3.46
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TPCN1-212ENST00000549279 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.54■■■■□ 3.44
TPCN1-212ENST00000549279 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.51■■■■□ 3.44
TPCN1-212ENST00000549279 PRDM2Q13029 1718 aa36.44■■■■□ 3.42
TPCN1-212ENST00000549279 WDR62O43379 1518 aa36.39■■■■□ 3.42
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TPCN1-212ENST00000549279 TOPBP1Q92547 1522 aa35.93■■■■□ 3.34
TPCN1-212ENST00000549279 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.91■■■■□ 3.34
TPCN1-212ENST00000549279 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.89■■■■□ 3.34
TPCN1-212ENST00000549279 IFT140Q96RY7 1462 aa35.78■■■■□ 3.32
TPCN1-212ENST00000549279 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
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TPCN1-212ENST00000549279 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
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TPCN1-212ENST00000549279 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.24■■■■□ 3.23
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TPCN1-212ENST00000549279 CHD1O14646 1710 aa35.06■■■■□ 3.2
TPCN1-212ENST00000549279 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.05■■■■□ 3.2
TPCN1-212ENST00000549279 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
TPCN1-212ENST00000549279 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.03■■■■□ 3.2
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TPCN1-212ENST00000549279 SYNJ2O15056 1496 aa34.89■■■■□ 3.18
TPCN1-212ENST00000549279 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.75■■■■□ 3.15
TPCN1-212ENST00000549279 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.73■■■■□ 3.15
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TPCN1-212ENST00000549279 ADAMTS12P58397 1594 aa34.71■■■■□ 3.15
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TPCN1-212ENST00000549279 TRIM41Q8WV44 630 aa34.67■■■■□ 3.14
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TPCN1-212ENST00000549279 KIF27Q86VH2 1401 aa34.59■■■■□ 3.13
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TPCN1-212ENST00000549279 CEP170Q5SW79 1584 aa34.45■■■■□ 3.11
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TPCN1-212ENST00000549279 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.38■■■■□ 3.09
TPCN1-212ENST00000549279 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.25■■■■□ 3.07
TPCN1-212ENST00000549279 SHROOM2Q13796 1616 aa34.24■■■■□ 3.07
TPCN1-212ENST00000549279 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.2■■■■□ 3.07
TPCN1-212ENST00000549279 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.14■■■■□ 3.06
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