Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL38P63173 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL38P63173 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL38P63173 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL38P63173 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL38P63173 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL38P63173 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL38P63173 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL38P63173 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL38P63173 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL38P63173 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL38P63173 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL38P63173 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL38P63173 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL38P63173 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL38P63173 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL38P63173 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL38P63173 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL38P63173 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL38P63173 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL38P63173 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL38P63173 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL38P63173 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL38P63173 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL38P63173 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL38P63173 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL38P63173 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL38P63173 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL38P63173 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL38P63173 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL38P63173 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL38P63173 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL38P63173 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL38P63173 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL38P63173 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL38P63173 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL38P63173 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL38P63173 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL38P63173 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL38P63173 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL38P63173 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL38P63173 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL38P63173 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL38P63173 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL38P63173 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL38P63173 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL38P63173 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL38P63173 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL38P63173 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL38P63173 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL38P63173 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL38P63173 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL38P63173 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL38P63173 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL38P63173 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL38P63173 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL38P63173 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL38P63173 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL38P63173 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL38P63173 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL38P63173 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL38P63173 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL38P63173 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL38P63173 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL38P63173 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL38P63173 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL38P63173 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL38P63173 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL38P63173 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL38P63173 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL38P63173 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL38P63173 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL38P63173 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms