Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX10P56693 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX10P56693 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX10P56693 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX10P56693 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX10P56693 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX10P56693 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX10P56693 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX10P56693 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX10P56693 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOX10P56693 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOX10P56693 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOX10P56693 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOX10P56693 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX10P56693 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX10P56693 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX10P56693 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX10P56693 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX10P56693 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX10P56693 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX10P56693 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX10P56693 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SOX10P56693 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX10P56693 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX10P56693 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX10P56693 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX10P56693 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX10P56693 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX10P56693 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOX10P56693 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOX10P56693 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SOX10P56693 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SOX10P56693 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX10P56693 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX10P56693 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX10P56693 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX10P56693 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX10P56693 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX10P56693 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX10P56693 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX10P56693 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX10P56693 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX10P56693 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX10P56693 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX10P56693 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX10P56693 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX10P56693 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX10P56693 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX10P56693 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX10P56693 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX10P56693 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX10P56693 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX10P56693 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX10P56693 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX10P56693 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX10P56693 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX10P56693 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX10P56693 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX10P56693 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SOX10P56693 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SOX10P56693 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SOX10P56693 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX10P56693 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX10P56693 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX10P56693 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX10P56693 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX10P56693 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX10P56693 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX10P56693 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX10P56693 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX10P56693 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX10P56693 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX10P56693 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX10P56693 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX10P56693 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX10P56693 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX10P56693 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX10P56693 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX10P56693 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX10P56693 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX10P56693 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX10P56693 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX10P56693 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX10P56693 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX10P56693 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX10P56693 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX10P56693 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX10P56693 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX10P56693 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms