Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms