Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE6CP51160 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms