Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IDH3AP50213 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms