Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TTPAP49638 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTPAP49638 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTPAP49638 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTPAP49638 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTPAP49638 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTPAP49638 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTPAP49638 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTPAP49638 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTPAP49638 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTPAP49638 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTPAP49638 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTPAP49638 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTPAP49638 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTPAP49638 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTPAP49638 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTPAP49638 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTPAP49638 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTPAP49638 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTPAP49638 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTPAP49638 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTPAP49638 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTPAP49638 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTPAP49638 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTPAP49638 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTPAP49638 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTPAP49638 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTPAP49638 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTPAP49638 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTPAP49638 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTPAP49638 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TTPAP49638 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TTPAP49638 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTPAP49638 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTPAP49638 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTPAP49638 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TTPAP49638 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTPAP49638 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TTPAP49638 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTPAP49638 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTPAP49638 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTPAP49638 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTPAP49638 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTPAP49638 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTPAP49638 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTPAP49638 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTPAP49638 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTPAP49638 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTPAP49638 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTPAP49638 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTPAP49638 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTPAP49638 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTPAP49638 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTPAP49638 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTPAP49638 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTPAP49638 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTPAP49638 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTPAP49638 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTPAP49638 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTPAP49638 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTPAP49638 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTPAP49638 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTPAP49638 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTPAP49638 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTPAP49638 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTPAP49638 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTPAP49638 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTPAP49638 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTPAP49638 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTPAP49638 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTPAP49638 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTPAP49638 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTPAP49638 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTPAP49638 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTPAP49638 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTPAP49638 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTPAP49638 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTPAP49638 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTPAP49638 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTPAP49638 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTPAP49638 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTPAP49638 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTPAP49638 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTPAP49638 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTPAP49638 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTPAP49638 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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