Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XCR1P46094 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XCR1P46094 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XCR1P46094 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XCR1P46094 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XCR1P46094 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XCR1P46094 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XCR1P46094 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XCR1P46094 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XCR1P46094 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XCR1P46094 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XCR1P46094 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XCR1P46094 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XCR1P46094 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XCR1P46094 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XCR1P46094 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XCR1P46094 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XCR1P46094 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XCR1P46094 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XCR1P46094 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XCR1P46094 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XCR1P46094 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XCR1P46094 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XCR1P46094 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XCR1P46094 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XCR1P46094 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XCR1P46094 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XCR1P46094 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XCR1P46094 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XCR1P46094 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XCR1P46094 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XCR1P46094 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XCR1P46094 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XCR1P46094 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XCR1P46094 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XCR1P46094 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XCR1P46094 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XCR1P46094 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XCR1P46094 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XCR1P46094 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XCR1P46094 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XCR1P46094 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XCR1P46094 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XCR1P46094 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XCR1P46094 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XCR1P46094 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XCR1P46094 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XCR1P46094 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XCR1P46094 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XCR1P46094 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XCR1P46094 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XCR1P46094 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XCR1P46094 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XCR1P46094 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XCR1P46094 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XCR1P46094 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XCR1P46094 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XCR1P46094 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XCR1P46094 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XCR1P46094 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XCR1P46094 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XCR1P46094 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XCR1P46094 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XCR1P46094 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XCR1P46094 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XCR1P46094 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XCR1P46094 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XCR1P46094 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XCR1P46094 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XCR1P46094 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XCR1P46094 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XCR1P46094 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XCR1P46094 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XCR1P46094 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XCR1P46094 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XCR1P46094 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XCR1P46094 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XCR1P46094 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XCR1P46094 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XCR1P46094 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XCR1P46094 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XCR1P46094 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XCR1P46094 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XCR1P46094 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XCR1P46094 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XCR1P46094 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XCR1P46094 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XCR1P46094 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XCR1P46094 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XCR1P46094 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XCR1P46094 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XCR1P46094 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XCR1P46094 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XCR1P46094 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XCR1P46094 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XCR1P46094 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XCR1P46094 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XCR1P46094 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XCR1P46094 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XCR1P46094 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms