Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV4P43268 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV4P43268 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV4P43268 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV4P43268 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV4P43268 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV4P43268 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV4P43268 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV4P43268 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV4P43268 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV4P43268 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV4P43268 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV4P43268 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV4P43268 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV4P43268 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV4P43268 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV4P43268 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV4P43268 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV4P43268 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV4P43268 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV4P43268 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV4P43268 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETV4P43268 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETV4P43268 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETV4P43268 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ETV4P43268 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETV4P43268 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETV4P43268 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ETV4P43268 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ETV4P43268 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV4P43268 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV4P43268 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV4P43268 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV4P43268 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV4P43268 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV4P43268 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV4P43268 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV4P43268 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV4P43268 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV4P43268 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV4P43268 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV4P43268 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETV4P43268 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETV4P43268 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETV4P43268 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETV4P43268 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETV4P43268 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETV4P43268 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETV4P43268 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETV4P43268 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETV4P43268 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETV4P43268 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETV4P43268 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV4P43268 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV4P43268 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV4P43268 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV4P43268 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV4P43268 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV4P43268 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV4P43268 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV4P43268 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV4P43268 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV4P43268 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV4P43268 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV4P43268 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV4P43268 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV4P43268 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ETV4P43268 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV4P43268 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV4P43268 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV4P43268 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV4P43268 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV4P43268 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV4P43268 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV4P43268 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV4P43268 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms