Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRATP43155 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRATP43155 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRATP43155 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRATP43155 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRATP43155 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRATP43155 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRATP43155 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CRATP43155 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRATP43155 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CRATP43155 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRATP43155 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRATP43155 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRATP43155 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRATP43155 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CRATP43155 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRATP43155 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRATP43155 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRATP43155 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRATP43155 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRATP43155 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRATP43155 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRATP43155 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRATP43155 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRATP43155 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRATP43155 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRATP43155 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRATP43155 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRATP43155 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRATP43155 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRATP43155 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRATP43155 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRATP43155 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRATP43155 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRATP43155 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRATP43155 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRATP43155 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRATP43155 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRATP43155 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRATP43155 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRATP43155 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRATP43155 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRATP43155 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRATP43155 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRATP43155 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRATP43155 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRATP43155 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRATP43155 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRATP43155 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRATP43155 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRATP43155 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRATP43155 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRATP43155 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRATP43155 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRATP43155 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRATP43155 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRATP43155 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRATP43155 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRATP43155 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRATP43155 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRATP43155 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRATP43155 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRATP43155 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRATP43155 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRATP43155 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRATP43155 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRATP43155 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRATP43155 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRATP43155 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRATP43155 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRATP43155 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRATP43155 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRATP43155 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRATP43155 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRATP43155 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRATP43155 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRATP43155 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRATP43155 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRATP43155 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRATP43155 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRATP43155 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRATP43155 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRATP43155 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRATP43155 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRATP43155 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRATP43155 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRATP43155 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRATP43155 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms