Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms