Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FDFT1P37268 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms