Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJC1P36383 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJC1P36383 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJC1P36383 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJC1P36383 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJC1P36383 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJC1P36383 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJC1P36383 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJC1P36383 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJC1P36383 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJC1P36383 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJC1P36383 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJC1P36383 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJC1P36383 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJC1P36383 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJC1P36383 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJC1P36383 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJC1P36383 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJC1P36383 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJC1P36383 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJC1P36383 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJC1P36383 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC1P36383 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC1P36383 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC1P36383 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC1P36383 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC1P36383 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC1P36383 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC1P36383 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC1P36383 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJC1P36383 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJC1P36383 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJC1P36383 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJC1P36383 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJC1P36383 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJC1P36383 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJC1P36383 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJC1P36383 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJC1P36383 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJC1P36383 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJC1P36383 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJC1P36383 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJC1P36383 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJC1P36383 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJC1P36383 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJC1P36383 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJC1P36383 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJC1P36383 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJC1P36383 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJC1P36383 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJC1P36383 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJC1P36383 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJC1P36383 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJC1P36383 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJC1P36383 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJC1P36383 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJC1P36383 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJC1P36383 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJC1P36383 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJC1P36383 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJC1P36383 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJC1P36383 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJC1P36383 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJC1P36383 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJC1P36383 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJC1P36383 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJC1P36383 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJC1P36383 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJC1P36383 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJC1P36383 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJC1P36383 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJC1P36383 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJC1P36383 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJC1P36383 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GJC1P36383 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJC1P36383 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJC1P36383 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJC1P36383 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJC1P36383 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJC1P36383 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GJC1P36383 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJC1P36383 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJC1P36383 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJC1P36383 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJC1P36383 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJC1P36383 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJC1P36383 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJC1P36383 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJC1P36383 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms