Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORAP35398 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORAP35398 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORAP35398 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORAP35398 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RORAP35398 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORAP35398 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORAP35398 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORAP35398 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RORAP35398 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORAP35398 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORAP35398 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORAP35398 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORAP35398 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORAP35398 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORAP35398 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORAP35398 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORAP35398 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORAP35398 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORAP35398 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORAP35398 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RORAP35398 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORAP35398 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RORAP35398 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RORAP35398 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RORAP35398 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RORAP35398 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RORAP35398 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RORAP35398 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORAP35398 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RORAP35398 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RORAP35398 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RORAP35398 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RORAP35398 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RORAP35398 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RORAP35398 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RORAP35398 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RORAP35398 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RORAP35398 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RORAP35398 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RORAP35398 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RORAP35398 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RORAP35398 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RORAP35398 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RORAP35398 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RORAP35398 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RORAP35398 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RORAP35398 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RORAP35398 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RORAP35398 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RORAP35398 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RORAP35398 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RORAP35398 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RORAP35398 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RORAP35398 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORAP35398 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORAP35398 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORAP35398 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORAP35398 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORAP35398 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORAP35398 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORAP35398 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORAP35398 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORAP35398 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORAP35398 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORAP35398 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RORAP35398 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RORAP35398 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RORAP35398 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RORAP35398 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RORAP35398 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RORAP35398 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RORAP35398 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RORAP35398 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RORAP35398 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RORAP35398 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RORAP35398 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RORAP35398 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RORAP35398 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RORAP35398 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RORAP35398 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORAP35398 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORAP35398 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORAP35398 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RORAP35398 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORAP35398 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORAP35398 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORAP35398 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RORAP35398 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms