Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GTF2H1P32780 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2H1P32780 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms