Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UQCRC1P31930 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UQCRC1P31930 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UQCRC1P31930 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms