Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMOD1P29536 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD1P29536 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms