Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP1P29466 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP1P29466 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP1P29466 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP1P29466 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP1P29466 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP1P29466 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP1P29466 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP1P29466 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP1P29466 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP1P29466 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP1P29466 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP1P29466 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP1P29466 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP1P29466 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP1P29466 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP1P29466 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP1P29466 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP1P29466 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP1P29466 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP1P29466 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP1P29466 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP1P29466 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP1P29466 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP1P29466 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP1P29466 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP1P29466 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP1P29466 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP1P29466 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP1P29466 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP1P29466 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP1P29466 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP1P29466 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP1P29466 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP1P29466 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP1P29466 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP1P29466 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP1P29466 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP1P29466 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP1P29466 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP1P29466 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP1P29466 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP1P29466 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP1P29466 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP1P29466 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP1P29466 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP1P29466 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP1P29466 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP1P29466 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP1P29466 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP1P29466 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP1P29466 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP1P29466 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP1P29466 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP1P29466 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP1P29466 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP1P29466 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP1P29466 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP1P29466 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP1P29466 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP1P29466 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP1P29466 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP1P29466 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP1P29466 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP1P29466 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP1P29466 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP1P29466 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP1P29466 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP1P29466 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP1P29466 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP1P29466 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP1P29466 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP1P29466 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP1P29466 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP1P29466 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP1P29466 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP1P29466 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP1P29466 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP1P29466 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP1P29466 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP1P29466 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP1P29466 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP1P29466 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP1P29466 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP1P29466 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP1P29466 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP1P29466 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP1P29466 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP1P29466 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP1P29466 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP1P29466 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP1P29466 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms