Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms