Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR2AP28223 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HTR2AP28223 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTR2AP28223 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTR2AP28223 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2AP28223 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2AP28223 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2AP28223 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2AP28223 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2AP28223 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2AP28223 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2AP28223 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2AP28223 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2AP28223 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2AP28223 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2AP28223 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2AP28223 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2AP28223 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2AP28223 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2AP28223 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2AP28223 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2AP28223 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR2AP28223 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR2AP28223 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms