Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE1P24864 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNE1P24864 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms