Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGFR4P22455 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGFR4P22455 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR4P22455 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms