Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPI1P17947 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPI1P17947 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPI1P17947 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPI1P17947 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPI1P17947 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPI1P17947 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPI1P17947 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPI1P17947 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPI1P17947 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPI1P17947 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPI1P17947 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPI1P17947 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPI1P17947 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPI1P17947 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPI1P17947 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPI1P17947 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPI1P17947 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPI1P17947 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPI1P17947 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPI1P17947 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPI1P17947 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPI1P17947 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPI1P17947 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPI1P17947 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPI1P17947 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPI1P17947 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPI1P17947 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPI1P17947 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPI1P17947 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPI1P17947 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPI1P17947 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPI1P17947 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPI1P17947 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPI1P17947 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SPI1P17947 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPI1P17947 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPI1P17947 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPI1P17947 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPI1P17947 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPI1P17947 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPI1P17947 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPI1P17947 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPI1P17947 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPI1P17947 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPI1P17947 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPI1P17947 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPI1P17947 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPI1P17947 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPI1P17947 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPI1P17947 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPI1P17947 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPI1P17947 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPI1P17947 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPI1P17947 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPI1P17947 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPI1P17947 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPI1P17947 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPI1P17947 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPI1P17947 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPI1P17947 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPI1P17947 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPI1P17947 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPI1P17947 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPI1P17947 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPI1P17947 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPI1P17947 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPI1P17947 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPI1P17947 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPI1P17947 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPI1P17947 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPI1P17947 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPI1P17947 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPI1P17947 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPI1P17947 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPI1P17947 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPI1P17947 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms