Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB1P14653 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms