Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFAPP14136 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFAPP14136 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFAPP14136 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFAPP14136 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFAPP14136 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFAPP14136 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFAPP14136 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFAPP14136 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFAPP14136 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFAPP14136 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFAPP14136 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GFAPP14136 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFAPP14136 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFAPP14136 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFAPP14136 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFAPP14136 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GFAPP14136 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GFAPP14136 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GFAPP14136 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GFAPP14136 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GFAPP14136 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GFAPP14136 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GFAPP14136 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFAPP14136 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFAPP14136 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFAPP14136 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFAPP14136 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GFAPP14136 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFAPP14136 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFAPP14136 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFAPP14136 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFAPP14136 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFAPP14136 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFAPP14136 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFAPP14136 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFAPP14136 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFAPP14136 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFAPP14136 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFAPP14136 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFAPP14136 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFAPP14136 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFAPP14136 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFAPP14136 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFAPP14136 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFAPP14136 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFAPP14136 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFAPP14136 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFAPP14136 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GFAPP14136 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFAPP14136 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFAPP14136 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFAPP14136 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFAPP14136 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFAPP14136 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFAPP14136 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFAPP14136 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GFAPP14136 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GFAPP14136 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFAPP14136 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GFAPP14136 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFAPP14136 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFAPP14136 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFAPP14136 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFAPP14136 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFAPP14136 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFAPP14136 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFAPP14136 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFAPP14136 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GFAPP14136 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFAPP14136 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFAPP14136 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFAPP14136 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFAPP14136 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFAPP14136 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFAPP14136 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFAPP14136 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFAPP14136 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms