Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYGBP11216 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYGBP11216 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYGBP11216 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYGBP11216 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYGBP11216 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYGBP11216 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYGBP11216 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGBP11216 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGBP11216 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGBP11216 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGBP11216 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGBP11216 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGBP11216 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGBP11216 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGBP11216 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGBP11216 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGBP11216 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGBP11216 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGBP11216 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGBP11216 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGBP11216 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGBP11216 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGBP11216 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGBP11216 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGBP11216 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGBP11216 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGBP11216 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGBP11216 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGBP11216 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGBP11216 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGBP11216 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGBP11216 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGBP11216 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGBP11216 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGBP11216 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGBP11216 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGBP11216 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGBP11216 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGBP11216 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGBP11216 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGBP11216 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGBP11216 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGBP11216 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGBP11216 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGBP11216 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGBP11216 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PYGBP11216 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYGBP11216 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYGBP11216 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYGBP11216 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYGBP11216 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYGBP11216 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYGBP11216 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PYGBP11216 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYGBP11216 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYGBP11216 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYGBP11216 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYGBP11216 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYGBP11216 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYGBP11216 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYGBP11216 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYGBP11216 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYGBP11216 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYGBP11216 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYGBP11216 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYGBP11216 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYGBP11216 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYGBP11216 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYGBP11216 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYGBP11216 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYGBP11216 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYGBP11216 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYGBP11216 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYGBP11216 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYGBP11216 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYGBP11216 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYGBP11216 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYGBP11216 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYGBP11216 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PYGBP11216 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYGBP11216 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYGBP11216 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PYGBP11216 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms